Secrétaire général du Département de l'éducation, de la culture et des sports, Alain Becker quitte ce poste en vue de donner une nouvelle impulsion à sa carrière professionnelle et de se perfectionner dans son métier.

Entré en fonction à l'Etat de Neuchâtel le 1er janvier 2002 en tant que secrétaire général du Département des finances et des affaires sociales dirigée alors par la Conseillère d'Etart Sylvie Perrinjaquet, il l'a rejointe au Département de l'éducation, de la culture et des sports le 1er juin 2005 pour y exercer la même fonction. Il a continué depuis son départ à exercer cette même charge lorsque le direction de ce département passa sous la houlette du Conseilller d'Etat Philippe Gnaegi.